علی مطهری در خصوص پیامدهای انتخابات ریاست جمهوری دهم ایرا

علی مطهری در خصوص پیامدهای انتخابات ریاست جمهوری دهم ایران معتقد است: «به هرحال شروع فتنه با احمدی‌نژاد بود و او هیزم فتنه را فراهم کرد و موسوی آنها را شعله‌ور ساخت.» وی معتقد است در صورتی که با تخلف احمدی‌نژاد، موسوی و کروبی با یک دید نگریسته می‌شد و از طریق مراجع قضایی به تخلفات آنها فوراً رسیدگی می‌شد، مدت اعتراضات چند ماه به طول نمی‌انجامید. وی عزت‌الله ضرغامی را مقصر بعدی ناآرامی‌ها عنوان می‌کند و معتقد است در صورتی که با شروع اعتراضات به درخواست موسوی مبنی بر حضور در تلویزیون در یک برنامه پخش مستقیم عمل می‌کرد، استدلال‌های معترضان مبنی بر تقلب در انتخابات پاسخ گفته می‌شد و درگیری‌ها اوج نمی‌گرفت. وی در دی ۱۳۹۲، در جمع دانشجویان دانشگاه علوم پزشکی شیراز در مورد حوادث سال ۱۳۸۸ گفت:

به نظر من احکامی که برای مصطفی تاج‌زاده و نبوی ارائه شد سختگیرانه بود در حالی که باید تخلفات آنها به صراحت و شفاف توضیح داده شود چرا که داشتن ارتباط با آمریکا و دیگران واضح و شفاف نیست.
طولانی شدن بدون محاکمه حصر موسوی و کروبی از لحاظ قانونی و شرعی مشکل دارد و اگر این افراد در حصر بمیرند نظام هزینه سنگینی را پرداخت خواهد کرد.
موسوی و کروبی از تخلفات مبری نیستند اما اگر قرار است آنها محاکمه گردند احمدی نژاد هم باید محاکمه شود.
او همچنین گفته:

اگر پس از انتخابات ۱۳۸۸ دولت اجازه تجمع را داده بود و سخنان معترضین را پخش می‌کرد هیچگاه چنین اتفاقاتی نمی‌افتاد.

حتی صدا و سیما نیز در اتفاقات پس از انتخابات ۱۳۸۸ مقصر بود چرا که اجازه دفاع به معترضین نداد. در قانون اساسی آزادی اجتماعات وجود دارد و اگر پس از انتخابات به این نکته از قانون عمل شده بود هیچ‌گاه شاهد چنین اتفاقاتی نبودیم.
وی در خصوص ۹دیماه سال ۸۸می‌گوید:" سالروز نهم دی ماه سال ۸۸ را گرامی می‌دارم. راه پیمایی خودجوش قشرها مختلف ملت ایران اعم از هواداران کاندیدای پیروز و معترضان به نتیجه انتخابات در این روز، نشانه رشد اجتماعی و سیاسی ملت ایران بود که قطع نظر از تخلفات دو طرف فتنه، به دفاع از اصل نظام جمهوری اسلامی پرداختند